厦门大学现有103个专业，主要王牌专业有经济学、财政学、金融学、国际经济与贸易、法学、英语、数学与应用数学、物理学、化学、海洋科学、生物科学、统计学、测控技术与仪器、电子信息工程、计算机科学与技术等。
厦门大学国家级特色专业：国际经济与贸易、广告学、会计学、化学、生物科学、统计学、数学与应用数学、材料科学与工程、法学、历史学、海洋科学、经济学、财政学、物理学、英语、金融学、行政管理
教育部卓越工程师教育培养计划专业：机械设计制造及其自动化、材料科学工程、电子信息科学与技术、自动化、计算机科学与技术、软件工程、化学工程与工艺、飞行器动力工程、建筑学
国家基础学科人才培养基地：化学、生物学、海洋科学、数学、经济学、历史学
卓越医生教育培养***：临床医学
卓越法律人才教育培养***：法学
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